저는 아래의 두 파일을 소스와 같이 사용하는데 아무 문제 없습니다.
참고하세요. ^^*


gbdelete.skin.php

<?
if (!defined("_GNUBOARD_")) exit; // 개별 페이지 접근 불가

if (!defined("_CONFIG_SKIN_"))
    include "$board_skin/config.skin.php";

$file_table = "$cfg[write_table_prefix]{$bo_table}_file";

// 업로드된 파일을 삭제함
for ($k=0; $k<$file_max; $k++) {
    $file_name = get_thumb_filename($wr_id, $k);
    @unlink("./data/file/$bo_table/${file_name}.jpg");
    @unlink("./data/file/$bo_table/${file_name}_s.jpg");
    @unlink("./data/file/$bo_table/${file_name}_s.jpgThumb");

}

// 행 삭제
$sql = " delete from $file_table where wr_id = '$wr_id' ";
sql_query($sql);
?>


gbupdate.skin.php

<?
if (!defined("_GNUBOARD_")) exit; // 개별 페이지 접근 불가

include "$board_skin/config.skin.php";

$msg = "";

for ($i=count($_POST["wf_cont"])-1; $i>=0; $i--)
{
    if ($_POST[wf_id_del][$i])
    {
        $file_name = get_thumb_filename($wr_id, $i);
        @unlink("./data/file/$bo_table/${file_name}.jpg");
        @unlink("./data/file/$bo_table/${file_name}_s.jpg");
    @unlink("./data/file/$bo_table/${file_name}_s.jpgThumb");

        $sql = " delete from $file_table where wr_id = '$wr_id' and wf_id = '$i' ";
        sql_query($sql);

        continue;
    }

    $file_name = get_thumb_filename($wr_id, $i);
    if ($_FILES["wf_file"][error][$i] == 0 && $_FILES["wf_file"][size][$i] <= ($file_size * 1024))
    {
        $src_file = $_FILES["wf_file"][tmp_name][$i];
        $dst_file = $image = "./data/file/$bo_table/$file_name.jpg";

move_uploaded_file($src_file, $dst_file);

        $size = getimagesize($image);
        $src = imagecreatefromjpeg($image);
        // 이미지 높이 비율
        $rate = $size[1] / $size[0];
        // 작은이미지의 높이
        $simg_height = (int)($simg_width * $rate);
        // 이미지가 jpg 라면
        if ($src)
        {
            // 이미지(소) 생성
            $dst = imagecreatetruecolor($simg_width, $simg_height);
            // 1.00.05 gd 버전에 따라
            if (function_exists("imagecopyresampled")) {
                imagecopyresampled($dst, $src, 0, 0, 0, 0, $simg_width, $simg_height, $size[0], $size[1]);
            } else {
                // 1.00.02 imagecopyresized -> imagecopyresampled 로 교체
                imagecopyresized($dst, $src, 0, 0, 0, 0, $simg_width, $simg_height, $size[0], $size[1]);
            }
            imagejpeg($dst, "./data/file/$bo_table/{$file_name}_s.jpg", $image_quality);
        }
    }
    else if ($_FILES["wf_file"][size][$i] > ($file_size * 1024))
    {
        $msg = "용량이 {$file_size}KB 이상되는 이미지 파일은 업로드 되지 않습니다.\\n\\n만약, 이미지가 업로드 되지 않았다면 용량이 초과한 경우일 겁니다.";
    }

    $file = "./data/file/$bo_table/{$file_name}_s.jpg";
    if ($_FILES["wf_file"][error][$i] == 0 || $_POST[wf_cont][$i] || file_exists($file))
    {
        $sql = " insert $file_table
                    set wr_id = '$wr_id',
                        wf_id = '$i',
                        wf_cont = '{$_POST[wf_cont][$i]}' ";
        $result = @mysql_query($sql);
        if (!$result)
        {
            $sql = " update $file_table
                        set wf_cont = '{$_POST[wf_cont][$i]}'
                      where wr_id = '$wr_id'
                        and wf_id = '$i' ";
            @mysql_query($sql);
        }
    }
    else
    {
        $sql = " delete from $file_table where wr_id = '$wr_id' and wf_id = '$i' ";
        @mysql_query($sql);
    }
}

if ($msg)
    echo "<script> alert('$msg'); </script>";

//print_r2($_FILES); exit;
?>

gnu3/bbs/gbdelete.php 파일중 105 라인을 보시면 아래와 같은 코드가있습니다.
파일 #1,#2는 아래의 코드로 삭제되지만,
폼에서 추가되었던 파일에 대한 처리를 해주지 않았다면 삭제 되지 않을꺼 같네요..

제가 멀티갤러리 스킨을써보지 않아서 ㅠㅠ;

만일 밑의 형태의 변수로써 5개의 파일까지 사용하게 수정하였다면 아래의 코드를 수정하시기  바랍니다.

===================================== 수정 전 =============================================
    // 파일삭제
    @unlink("./data/file/$bo_table/$write[wr_file1]");
    @unlink("./data/file/$bo_table/$write[wr_file2]");
===================================== 수정 후 =============================================
    // 파일삭제
    for ($i=1; $i<=$cfg[file_count]; $i++) {                                        // 추가된 파일 갯수 5개라면
      if (file_exists("./data/file/$bo_table/$write[wr_file{$i}]")) {
          @unlink("./data/file/$bo_table/$write[wr_file{$i}]");
      }
    }
==========================================================================================

이코드는 향후 개발자님에 의해서 수정되어야 할부분 같네요..