어디가 잘못된 것인지 확인할 소스가 없습니다.

head.php의 메인메뉴 관련 소스는 아래와 같구요,.....

    <nav id="gnb">
        <h2>메인메뉴</h2>
        <div class="gnb_wrap">
            <ul id="gnb_1dul">
                <li class="gnb_1dli gnb_mnal"><button type="button" class="gnb_menu_btn" title="전체메뉴"><i class="fa fa-bars" aria-hidden="true"></i><span class="sound_only">전체메뉴열기</span></button></li>
                <?php
                $menu_datas = get_menu_db(0, true);
                $gnb_zindex = 999; // gnb_1dli z-index 값 설정용
                $i = 0;
                foreach( $menu_datas as $row ){
                    if( empty($row) ) continue;
                    $add_class = (isset($row['sub']) && $row['sub']) ? 'gnb_al_li_plus' : '';
                ?>
                <li class="gnb_1dli <?php echo $add_class; ?>" style="z-index:<?php echo $gnb_zindex--; ?>">
                    <a href="<?php echo $row['me_link']; ?>" target="_<?php echo $row['me_target']; ?>" class="gnb_1da"><?php echo $row['me_name'] ?></a>
                    <?php
                    $k = 0;
                    foreach( (array) $row['sub'] as $row2 ){

                        if( empty($row2) ) continue; 

                        if($k == 0)
                            echo '<span class="bg">하위분류</span><div class="gnb_2dul"><ul class="gnb_2dul_box">'.PHP_EOL;
                    ?>
                        <li class="gnb_2dli"><a href="<?php echo $row2['me_link']; ?>" target="_<?php echo $row2['me_target']; ?>" class="gnb_2da"><?php echo $row2['me_name'] ?></a></li>
                    <?php
                    $k++;
                    }   //end foreach $row2

                    if($k > 0)
                        echo '</ul></div>'.PHP_EOL;
                    ?>
                </li>
                <?php
                $i++;
                }   //end foreach $row

                if ($i == 0) {  ?>
                    <li class="gnb_empty">메뉴 준비 중입니다.<?php if ($is_admin) { ?> <a href="<?php echo G5_ADMIN_URL; ?>/menu_list.php">관리자모드 > 환경설정 > 메뉴설정</a>에서 설정하실 수 있습니다.<?php } ?></li>
                <?php } ?>
            </ul>
            <div id="gnb_all">
                <h2>전체메뉴</h2>
                <ul class="gnb_al_ul">
                    <?php
                    
                    $i = 0;
                    foreach( $menu_datas as $row ){
                    ?>
                    <li class="gnb_al_li">
                        <a href="<?php echo $row['me_link']; ?>" target="_<?php echo $row['me_target']; ?>" class="gnb_al_a"><?php echo $row['me_name'] ?></a>
                        <?php
                        $k = 0;
                        foreach( (array) $row['sub'] as $row2 ){
                            if($k == 0)
                                echo '<ul>'.PHP_EOL;
                        ?>
                            <li><a href="<?php echo $row2['me_link']; ?>" target="_<?php echo $row2['me_target']; ?>"><?php echo $row2['me_name'] ?></a></li>
                        <?php
                        $k++;
                        }   //end foreach $row2

                        if($k > 0)
                            echo '</ul>'.PHP_EOL;
                        ?>
                    </li>
                    <?php
                    $i++;
                    }   //end foreach $row

                    if ($i == 0) {  ?>
                        <li class="gnb_empty">메뉴 준비 중입니다.<?php if ($is_admin) { ?> <br><a href="<?php echo G5_ADMIN_URL; ?>/menu_list.php">관리자모드 > 환경설정 > 메뉴설정</a>에서 설정하실 수 있습니다.<?php } ?></li>
                    <?php } ?>
                </ul>
                <button type="button" class="gnb_close_btn"><i class="fa fa-times" aria-hidden="true"></i></button>
            </div>
            <div id="gnb_all_bg"></div>
        </div>
    </nav>
    <script>
    
    $(function(){
        $(".gnb_menu_btn").click(function(){
            $("#gnb_all, #gnb_all_bg").show();
        });
        $(".gnb_close_btn, #gnb_all_bg").click(function(){
            $("#gnb_all, #gnb_all_bg").hide();
        });
    });

    </script>
</div>

관련 css는 아래와 같습니다....

/* 메인메뉴 */
#gnb {position:relative;background:#fff; border-top:1px solid #e0e3e6;border-bottom:1px solid #e0e3e6;}
#gnb > h2 {position:absolute;font-size:0;line-height:0;overflow:hidden;}
#gnb .gnb_wrap {margin:0 auto;position:relative}
#gnb .gnb_wrap:hover, #gnb .gnb_wrap:focus, #gnb .gnb_wrap:active{z-index:3}
#gnb #gnb_1dul {font-size:1.083em;padding:0;border-bottom:10px solid #eee;zoom:1;}
#gnb ul:after {display:block;visibility:hidden;clear:both;content:""}
#gnb .gnb_1dli {float:left;line-height:55px;padding:0px;position:relative}
#gnb .gnb_1dli:hover > a {color:#3a8afd;
-webkit-transition:background-color 2s ease-out;
-moz-transition:background-color 0.3s ease-out;
-o-transition:background-color 0.3s ease-out;
transition:background-color 0.3s ease-out}

.gnb_1dli .bg {position:absolute;top:24px;right:8px;display:inline-block;width:10px;height:10px;overflow:hidden;background:url('../img/gnb_bg2.gif') no-repeat 50% 50%;text-indent:-999px}
.gnb_1da {display:block;font-weight:bold;padding:0 15px;color:#080808;text-decoration:none}
.gnb_1dli.gnb_al_li_plus .gnb_1da{padding-right:25px}
.gnb_2dli:first-child {border:0}
.gnb_2dul {display:none;position:absolute;top:54px;min-width:140px;padding-top:2px}
.gnb_2dul .gnb_2dul_box {border:1px solid #e0e2e5;border-top:0;padding:0;
-webkit-box-shadow:0px 1px 5px rgba(97, 97, 97, 0.2);
-moz-box-shadow:0px 1px 5px rgba(97, 97, 97, 0.2);
box-shadow:0px 1px 5px rgba(97, 97, 97, 0.2)}
.gnb_2da {display:block;padding:0 10px;line-height:40px;background:#fff;color:#080808;text-align:left;text-decoration:none}
a.gnb_2da:hover {color:#3a8afd;background:#f7f7f8;
-moz-transition:all 0.3s ease-out;
-o-transition:all 0.3s ease-out;
transition:all 0.3s ease-out}

.gnb_1dli_air .gnb_2da {}
.gnb_1dli_on .gnb_2da {}
.gnb_2da:focus, .gnb_2da:hover {color:#fff}
.gnb_1dli_over .gnb_2dul {display:block;left:0}
.gnb_1dli_over2 .gnb_2dul {display:block;right:0}
.gnb_wrap .gnb_empty {padding:10px 0;width:100%;text-align:center;line-height:2.7em;color:#080808}
.gnb_wrap .gnb_empty a {color:#3a8afd;text-decoration:underline}
.gnb_wrap .gnb_al_ul .gnb_empty, .gnb_wrap .gnb_al_ul .gnb_empty a {color:#555}

#gnb .gnb_menu_btn {background:#ff5400;color:#fff;width:50px;height:55px;border:0;vertical-align:top;font-size:18px}
#gnb .gnb_close_btn {background:#000;color:#fff;width:50px;height:50px;border:0;vertical-align:top;font-size:18px;position:absolute;top:0;right:0}
#gnb .gnb_mnal {float:right;padding:0}

#gnb_all {display:none;position:absolute;border:0px solid #c5d6da;width:100%;background:#fff;z-index:1000;-webkit-box-shadow:0 2px 5px rgba(0,0,0,0.2);
-moz-box-shadow:0 2px 5px rgba(0,0,0,0.2);
box-shadow:0 2px 5px rgba(0,0,0,0.2)}
#gnb_all h2 {font-size:1.3em;color:#080808;padding:15px 20px;border-bottom:1px solid #e7eeef; background:#000;}
#gnb_all .gnb_al_ul:after {display:block;visibility:hidden;clear:both;content:""}
#gnb_all .gnb_al_ul > li:nth-child(5n+1) {border-left:0}
#gnb_all .gnb_al_li {float:left;width:20%;min-height:150px;padding:20px;border-left:1px solid #e7eeef}
#gnb_all .gnb_al_li .gnb_al_a {font-size:1.2em;display:block;position:relative;margin-bottom:10px;font-weight:bold;color:#3a8afd}
#gnb_all .gnb_al_li li {line-height:2em}
#gnb_all .gnb_al_li li a {color:#555}
#gnb_all_bg {display:none;background:rgba(0,0,0,0.1);width:100%;height:100%;position:fixed;left:0;top:0;z-index:999}
 

오른쪽 정렬은

#gnb .gnb_mnal {float:right;padding:0}

이부분이 적용되서 그러지 않을까 합니다.

해당 페이지 주소(URL)을 올려 보세요.