전체 테이블을 대상으로 최신글을 가져오는 경우
new.php
1. 38행 수정
$sql = " select a.*, b.bo_subject, b.bo_notice, c.gr_subject, c.gr_id
2. 70행 쯤  $datetime2 = "<font color='blue'>".$datetime2; 다음행에 아래 스크립트 추가
  if(strstr($row[bo_notice],$row[wr_id]) ) $list[$i][is_notice]=1;
    else $list[$i][is_notice]=0;

3. new.skin.php 70행 쯤 for문 아래에 다음 추가
  if( !$list[$i][is_notice]) continue;
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이렇게 하면 최신글 중 공지체크한 글만 출력 합니다

latest('basic'.....) 함수를 이용하는 경우
latest/basic/basic.skin.php 14번 행을 수정 하면 됩니다

<? for ($i=0; $i<count($list); $i++) {
    if (! $list[$i]['is_notice']) continue;
?>

한칸이 당연히 줄어 들 것입니다.
왜냐면 미리 정해진 수만큼만 읽어왔기 때문에 $list엔 그만큼밖에 없는것이죠.
균이님이 알려주신 내용이 최대한 수정을 적게하시라고 알려주신거 같습니다만,
맘에 안드시면
latest함수 자체를 수정하셔야 할것 같습니다.

lib/latest.lib.php 를 열어줍니다.
호출할때 $options 를 받도록 되어있지만, 쓰이지 않는다는것을 알 수 있습니다.
이걸 이용해 봅시다.

주욱 내리시면
    $sql = " select * from $tmp_write_table where wr_is_comment = 0 order by wr_datetime desc limit 0, $rows ";
//explain($sql);
$result = sql_query($sql);
for ($i=0; $row = sql_fetch_array($result); $i++)
$list[$i] = get_list($row, $board, $latest_skin_path, $subject_len);
이부분이 있습니다.

여기를
if($option=="notice"){
$notices = split("\n", trim($board[bo_notice]));
$notices_cnt = count($notices);
$rcnt=0;
for($i=0;$i<$notices_cnt;$i++){
if($rcnt>=$rows) break;
$row = sql_fetch("select * from $tmp_write_table where wr_id='$notices[$i]'");
if($row['wr_id']) {
$list[$rcnt] = get_list($row,$board,$latest_skin_path, $subject_len);
}else continue;
$rcnt++;
}
}else{
    $sql = " select * from $tmp_write_table where wr_is_comment = 0 order by wr_datetime desc limit 0, $rows ";
//explain($sql);
$result = sql_query($sql);
for ($i=0; $row = sql_fetch_array($result); $i++)
$list[$i] = get_list($row, $board, $latest_skin_path, $subject_len);
}

이런식으로 바꿔준후에
latest("스킨","테이블",개수,길이,"notice");
이렇게 불러줍니다.

즉흥적으로 짠거라 잘 안될수도 있습니다. ㅠ
안되면 다시 리플 달아주시면 테스트 해보고 다시 올려드리겠습니다.