이거 제가 write_update.skin.php에 붙여 두가지 워터마크 테스트를 해본 코드입니다.
$board['bo_image_width']에 맞춰서 새로운 파일을 생성하고 워터마크를 씌우는 형식으로 기억합니다만, 잘 되던데요,,

<?
if (!defined("_GNUBOARD_")) exit; // 개별 페이지 접근 불가

//실행되는 동안 종료 되지 않도록 사용메모리와 실행가능 시간을 늘려준다. 유창화님
@set_time_limit (0);
@ini_set ("memory_limit", "20M");

//워터마크 테트스 1 - 이미지 형식
//http://www.sir.co.kr/bbs/tb.php/g4_skin/28315 푸름빠덜님
function waterMark($fileInHD, $wmFile, $transparency = 100, $jpegQuality = 100, $margin = 5) {
    $wmImg  = imageCreateFromGIF($wmFile);
    $jpegImg = imageCreateFromJPEG($fileInHD);
    $wmX=imageSX($jpegImg) - imageSX($wmImg);
    $wmY=imageSY($jpegImg) - imageSY($wmImg);
    //$background_color = imagecolorallocate($jpegImg, 255,255,255);
    imageCopyMerge($jpegImg, $wmImg, $wmX, $wmY, 0, 0, imageSX($wmImg), imageSY($wmImg), $transparency);
    ImageJPEG($jpegImg, $fileInHD, $jpegQuality);
}
//워터마크 1 펑션 끝

//특정 폴더에 규격설정 이미지 생성 테스트
$data_path = $g4['path'] . "/data/file/" . $bo_table;
$rs_path = $data_path . "/rs_file";

if (!is_dir($rs_path)) {
    @mkdir($rs_path, 0707);
    @chmod($rs_path, 0707);
}

$sql = " select * from " . $g4['board_file_table'] . " where  bo_table = '" . $bo_table . "' ";
//규격 재설정후 일괄적용하려면 아래 한줄을 주석처리후 아무 게시물이나 1회 수정해줍니다. 시간좀 걸리네요.^^;;
$sql .= " and wr_id = '" . $wr_id . "' order by bf_no asc";

$results = sql_query($sql);
for ($i=0; $row=sql_fetch_array($results); $i++) {

    $file = $row['bf_file'];

    $dest_file = $data_path ."/". $file;

    if (preg_match("/\.(jp[e]?g|gif|png)$/i", $file) && file_exists($dest_file)) {

        //원본 이미지에 워터마크 1-1 표시
        //--------------
        if ($_FILES['bf_file']['name'][$i]){
            waterMark($dest_file,$board_skin_path."/img/watermark.gif");//이미지 타잎
        }
        //--------------

        //--------------------------------------- $board['bo_image_width']에 따른 규격파일 생성
        //규격 재설정시 레코드당 수정1회 필요함

        $rs_file = $rs_path . "/" . $file;

        $size = getimagesize($dest_file);
        if ($size[2] == 1)
            $src = imagecreatefromgif($dest_file);
        else if ($size[2] == 2)
            $src = imagecreatefromjpeg($dest_file);
        else if ($size[2] == 3)
            $src = imagecreatefrompng($dest_file);
        else
        break;

        //워터마크 테스트 2 http://www.sir.co.kr/bbs/tb.php/g3_tiptech/126 마스터케빈
        //규격파일 생성시 문자형태 워터마크 표시
        $string_b = $_SERVER["HTTP_HOST"];  //abc.co.kr을 취함
        $string_c=$member['mb_id']; //아이디
        $string_a=$member['mb_nick']; //닉네임

        $x1=($size[0]-151); // 좌측 x좌표
        $y1=($size[1]-27); // 촤측 y좌표
        $x2=($size[0]-10); // 우측 x좌표
        $y2=($size[1]-10); // 우측 y좌표
        $gray=ImageColorAllocate($src,170,170,170); // 회색색깔을 구한다. 이작업시 #ffffff 와 같은 방식은 쓸수 없다.
        $white=ImageColorAllocate($src,255,255,255); // 하얀색을 구한다.
        $black=ImageColorAllocate($src,0,0,0); // 검정색을 구한다.
        $blue=ImageColorAllocate($src,83,111,183); // 푸른색을 구한다.
        ImageString($src,2,$x1+7,$y1+1,$string_a,$white); // 우측하단에 글자 넣기
        ImageString($src,2,$x1+8,$y1+2,$string_a,$black); // 우측하단 글자 음영
        ImageString($src,6,11,11,$string_b,$black); // 촤측 상단 글자 넣기
        ImageString($src,6,10,10,$string_b,$blue); // 좌측 상단 글자 음영

        ImageString($src,5,11,26,$string_c,$black);
        ImageString($src,5,10,25,$string_c,$gray);
        //------------
        //최대 사이즈 제한 방식
        if ($size[0] >= $size[1]) :
            $rate = $board['bo_image_width'] / $size[0];
            $width = $board['bo_image_width'];
            $height = (int)($size[1] * $rate);
        else :
            $rate = $board['bo_image_width'] / $size[1];
            $width = (int)($size[0] * $rate);
            $height = $board['bo_image_width'];
        endif;
        //규격 설정보다 작은 파일 처리
        if (($size[0] < $board['bo_image_width']) and ($size[1] < $board['bo_image_width'])) :
            $width = $size[0];
            $height = $size[1];
        endif;
        //규격에 맞지않다면 삭제
        if (($width != $board['bo_image_width']) or ($height != $board['bo_image_width'])) :
            @unlink($rs_file);
        endif;

        if (!file_exists($rs_file)) :
        $dst = imagecreatetruecolor($width, $height);
            imagecopyresampled($dst, $src, 0, 0, 0, 0, $width, $height, $size[0], $size[1]);
            //imagepng($dst, $rs_file, $board['bo_2']);
            imagejpeg($dst, $rs_file, $board['bo_2']);
            chmod($rs_file, 0707);
        endif;

    }
}