php 프로그래밍에서 .은 문자열 연산자로 문자열을 붙인다고 생각하시면 됩니다.
echo " " . $list[$i][icon_file];?>
은 한칸띄고 $list[$i][icon_file] 를 출력하라는 뜻입니다.
[예]
<?
$a ="홍길동";
$b="만세";
echo $a."  " $b;
?>
출력결과 : 홍길동  만세

질문의 요지를 제가 제대로 파악했다면 . 점은 코드를 구분하는 경계점인듯합니다.
즉 코드를 읽는것과 문자열을 인식하는 차이죠.
예를 들어
echo $list[$i][icon_file]; 이런식으로 코드를 읽는데 이 앞과 뒤에 문자열이 포함되는경우
echo "시작".$list[$i][icon_file]."끝";
이렇게 경계점을 주는듯 합니다.
또다른 방법으로는
echo "시작{$list[$i][icon_file]}끝";
이렇게 써도 되지요.

위 코드는 음......정말 윗분말씀데로 한칸은 띄우기 위한건지 아니면 불필요하게 잇는건지는 모르겠지만
그렇네요......저도 배우고 잇는 단계라 설명이 부족해도 양해를.......

echo " " . $list[$i][icon_file];
에서
echo " "$list[$i][icon_file];
이렇게요...?

이것은 PHP문법에 어긋납니다.
PHP 변수는 $로 시작되어야 합니다. $count, $list[i][icon_file], $i.... 등
$다음에는 항상 영문자, _ 로 첫자가 시작되어야 합니다.