//원래 있는부분
lib/latest.lib.php 부분에
$sql = " select * from $tmp_write_table where wr_is_comment = 0 order by wr_num limit 0, $rows ";

아래 처럼 등록하신면 될듯 합니다
$notice_array = explode("\n", trim($board[bo_notice]));
$notice_count = count($notice_array):
$notice_str = "";
if($notice_count)
{
for($k =0 ; $k < $notice_count ; $k++)
{
$notice_array[$k] = " wr_id != '".$notice_array[$k]."' " ;
}
$notice_str = " AND ".implode(" AND " , $notice_array);." ";
}
$sql = " select * from $tmp_write_table where wr_is_comment = 0 $notice_str order by wr_num limit 0, $rows ";


카테고리별 공지 사항은
bbs/list.php  를 건드리셔도 되고

skin 폴더에 list.skin.php 의
리스트 부분에 루프 돌릴때
for ($i=0; $i<count($list); $i++) {
밑에 아래 if 문으로 필터를 해주시면 될듯 합니다
//공지가 아니고 , 공지면 현 카테고리만 보이게
 if (!$list[$i][is_notice] || ( $list[$i][is_notice] && ( $list[$i][ca_name] == $sca || $sca == "")  ){