제가 php와 그누보드가 처음이라 어떤 내용을 적어야 파악하실때 도움이 될지 모르겠네요..  
음.. 우선 .htaccess 파일은 
# <FilesMatch "\.(htaccess|htpasswd|[Pp][Hh][Pp]|[Pp][Hh][Tt]|[Pp]?[Hh][Tt][Mm][Ll]?|[Ii][Nn][Cc]|[Cc][Gg][Ii]|[Pp][Ll]|[Pp][Hh][Aa][Rr])">
# Order allow,deny
# Deny from all
# </FilesMatch>
#### 그누보드5 rewrite BEGIN #####
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -f [OR]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -d
RewriteRule ^ - [L]
RewriteRule ^content/([0-9a-zA-Z_]+)$  bbs/content.php?co_id=$1&rewrite=1  [QSA,L]
RewriteRule ^content/([^/]+)/$  bbs/content.php?co_seo_title=$1&rewrite=1      [QSA,L]
RewriteRule ^rss/([0-9a-zA-Z_]+)$  bbs/rss.php?bo_table=$1        [QSA,L]
RewriteRule ^([0-9a-zA-Z_]+)$  bbs/board.php?bo_table=$1&rewrite=1      [QSA,L]
RewriteRule ^([0-9a-zA-Z_]+)/([^/]+)/$ bbs/board.php?bo_table=$1&wr_seo_title=$2&rewrite=1      [QSA,L]
RewriteRule ^([0-9a-zA-Z_]+)/write$  bbs/write.php?bo_table=$1&rewrite=1    [QSA,L]
RewriteRule ^([0-9a-zA-Z_]+)/([0-9]+)$  bbs/board.php?bo_table=$1&wr_id=$2&rewrite=1  [QSA,L]
</IfModule>
#### 그누보드5 rewrite END #####
요렇게 하는중이고 
apache2.conf 는 
        Options Indexes FollowSymLinks
        AllowOverride ALL
        Require all granted
설정이 되어이 있고  추가로 
#<FilesMatch "^\.ht">
#       Require all denied
#</FilesMatch> 
이건 주석 처리해놨습니다.